Alþjóðamálastofnun
Vettvangur rannsókna og fræðslu um alþjóðamál.

Bókmenntafræðistofnun
Kennsla og rannsóknir á íslenskum bókmenntum og almennri bókmenntafræði. 

Félagsvísindastofnun
Sinnir útgáfustarfsemi á sviði félagsvísinda og hagnýtar sem fræðilegar rannsóknir í félagsvísindum. 

Guðfræðistofnun
Rannsókna-, þjónustu- og kennslustofnun í guðfræði og greinum henni skyldum sem stundaðar eru í guðfræðideild. 

Hagfræðistofnun
Rannsóknir í hagfræði og öflun þekkingar á þjóðarbúskap Íslendinga.

Háskólasetrið í Hveragerði
Umhverfis- og vistfræðirannsóknir á hverum. 

Heimspekistofnun
Rannsóknir í heimspeki og er ráðgefandi varðandi kennslu, námsefni og próf í heimspeki í skólum landsins. Útgáfa ritverka um heimspekileg málefni. 

Hugvísindastofnun
Vettvangur rannsókna- og þróunarstarfs á fræðasviðum hugvísindadeildar. Veitir aðildarstofnunum og fræðimönnum þjónustu og aðstoð við verkefni sem tengjast rannsóknum og gengst fyrir ráðstefnum, málstofum og útgáfu fræðirita.

Íslensk málstöð
Sjá Stofnun Árna Magnússonar í íslenskum fræðum

Jarðvísindastofnun Háskólans
Stundar rannsóknir og kennslu á sviði jarðvísinda með áherslu á jarðfræðilegar aðstæður Íslands og nánasta umhverfi þess.

Lagastofnun
Vísindaleg rannsókna- og kennslustofnun í lögfræði og skyldum greinum.

Lífeðlisfræðistofnun
Veitir öllum fastráðnum kennurum Háskólans í lífeðlisfræði rannsóknaraðstöðu. Einnig getur stjórn stofnunarinnar veitt vísindamönnum á öðrum fræðasviðum aðstöðu eftir því sem aðstæður leyfa og efni standa til.

Lífefna-og sameindalíffræðistofa
Rannsóknarstofan er starfsvettvangur kennara fræðasviðsins í lífefnafræði, meinefnafræði og erfðalæknisfræði við læknadeild.

Líffræðistofnun
Eflir rannsóknir og kennslu í líffræði á Íslandi. Jafnramt tekur stofnunin að sér rannsóknir á hagnýtum sviðum líffræðinnar.

Lyfjafræðistofnun HÍ

Mannfræðistofnun
Rannsóknir á sviði félagslegrar og líffræðilegrar mannfræði.

Mannréttindastofnun HÍ
Vinnur að rannsóknum á lögfræðilegum þáttum mannréttinda, annast dreifingu á niðurstöðum þeirra og styður kennslu á þessu sviði.

Málvísindastofnun
Grundvallarrannsóknir í íslenskum og almennum málvísindum. 

Náttúrurannsóknastöðin við Mývatn
Vinnur í nánu samstarfi við Líffræðistofnun að rannsóknum á Mývatni og umhverfi þess. 

Norræna eldfjallasetrið
Samnorræn stofnun er hefur það hlutverk að stunda rannsóknir í eldfjallafræði með áherslu á bergfræði, jarðefnafræði, jarðeðlisfræði og eldfjallasögu.

Orðabók Háskólans
Sjá Stofnun Árna Magnússonar í íslenskum fræðum

Rannsóknarmiðstöð í jarðskjálftaverkfræði
Á vegum Rannsóknarmiðstöðvar í jarðskjálftaverkfræði, sem staðsett er á Selfossi, er unnið að fjölfaglegum rannsóknum á eðli og áhrifum jarðskjálfta.

Rannsóknasetur í barna- og fjölskylduvernd
Rannsóknasetur í barna- og fjölskylduvernd hefur það að markmiði að efla fjölskyldurannsóknir í félagsráðgjöf. Fjölskyldurannsóknir fjalla um samskipti og samspil í fjölskyldum og taka til allra aldurshópa og lífsskeiða.

Rannsóknasetur í fötlunarfræðum

Rannsóknasetur um smáríki
Markmið rannsóknasetursins er að auka rannsóknir og fræðslu í smáríkjafræðum (small state studies).

Rannsóknasetur Vestmannaeyja
Útibú Háskóla Íslands í Vestmannaeyjum. Áhersla er lögð á rannsóknir og rannsóknatengt nám í náttúruvísindum og greinum sem tengjast atvinnulífinu í Eyjum.

Rannsóknastofa í heilbrgiðisfræði
Rannsóknastofan er starfsvettvangur kennara fræðasviðanna faraldsfræði og heilbrigðisfræði.

Rannsóknastofa í hreyfivísindum

Rannsóknastofa í kvenna- og kynjafræðum
Öflun og miðlun þekkingar á sviðum kvenna- og kynjafræða.

Rannsóknastofa í klínískri lífefnafræði

Rannsóknastofa í lyfja- og eiturefnafræði
Í stofunni er unnið að grunn- og þjónusturannsóknum í líflyfjafræði, réttarefnafræði og eiturefnafræði.

Rannsóknastofa í matvælaefnafræði

Rannsóknastofa í meinafræði

Rannsóknastofa í næringarfræði

Rannsóknastofa í vinnuvernd
Rannsóknastofa í vinnuvernd (RIV) er vísindaleg rannsókna- og fræðslustofa sem er starfrækt af Vinnueftirlitinu og Háskóla Íslands.

Rannsóknastofa Krabbameinsfélags Íslands í sameinda- og frumulíffræði
Rannsóknir sem auka þekkingu og skilning á eðli krabbameins.

Rannsóknastofa um mannlegt atferli
Rannsóknir og (líkana og hugbúnaðar) þróun varðandi skipulag mannlegs samskiptaatferlis.

Rannsóknastofnun í hjúkrunarfræði
Hlutverk hennar er að efla tengsl rannsókna og kennslu og samhæfa rannsóknir í hjúkrunar- og ljósmóðurfræði við Háskóla Íslands.

Raunvísindastofnun Háskólans
Á Raunvísindastofnun eru stundaðar grunnrannsóknir í raunvísindum.

Rannsóknastofnun um lyfjamál

Sagnfræðistofnun
Annast rannsóknir í sagnfræði og gengst fyrir ráðstefnum, námskeiðum, fyrirlestrum og hvers kyns annarri starfsemi sem kynnir sagnfræði fyrir almenningi.

Siðfræðistofnun
Rannsókna-, fræðslu- og þjónustustofnun, er meðal annars vettvangur þverfaglegs samstarfs á sviði siðfræði.

Stofnun Árna Magnússonar í íslenskum fræðum
Hlutverk Stofnunar Árna Magnússonar í íslenskum fræðum er að vinna að rannsóknum í íslenskum fræðum og skyldum fræðigreinum, einkum á  sviði íslenskrar tungu og bókmennta, að miðla þekkingu á þeim fræðum  og varðveita og efla þau söfn sem henni eru falin eða hún á.

Stofnun fræðasetra við Háskóla Íslands

Stofnun stjórnsýslufræða og stjórnmála.
Meginmarkmið Stofnunar stjórnsýslufræða og stjórnmála er að efla kennslu og rannsóknir í stjórnun opinberra stofnana, bæði ríkis og sveitarfélaga.

Stofnun Sæmundar fróða
Meginhlutverk stofnunarinnar er tvíþætt: að stuðla að rannsóknum og samstarfi um hina ýmsu þætti sjálfbærrar þróunar og að vera vettvangur fyrir þverfræðilegar rannsóknir háskólakennara og sérfræðinga.

Stofnun Vigdísar Finnbogadóttur í erlendum tungumálum
Rannsóknir á erlendum tungumálum. Meðal rannsóknasviða eru: málvísindi, bókmenntir og menningarfræði, notagildi erlendra tungumála í atvinnulífi, kennsla erlendra tungumála og þýðingar. Útgáfa rita um sama efni. Ráðgjöf um framangreind fræðasvið.

Tannlækningastofnun
Rannsókna-, fræðslu- og þjónustustofnun í tannlæknisfræði og skyldum greinum sem stundaðar eru við tannlæknadeild.

Tilraunastöð HÍ í meinafræði að Keldum
Meginviðfangsefni eru rannsóknir og greining sjúkdóma í dýrum og framleiðsla bóluefna gegn sauðfjársjúdómum.

Verkfræðistofnun Háskóla Íslands
Rannsóknir og þróunarstarfsemi á sviði tækni og verkvísinda.

Viðskiptafræðistofnun
Vettvangur til að sinna rannsóknum, samhæfa þær og kynna niðurstöður þeirra. Stofnunin myndar einnig tengsl í viðskiptafræðum og skyldum greinum milli deildarinnar og aðila utan hennar gegnum þjónusturannsóknir, ráðgjöf og álitsgerðir.

Örnefnastofnun
Sjá Stofnun Árna Magnússonar í íslenskum fræðum